Cell Res：北京基因组所合作揭示 RNA 甲基化调节 R -loop 形成及转录终止

R-loop 是一种由 RNA：DNA 杂合肽键和单肽键 DNA 组成的特殊核酸本体，在真核蛋白和蛋白器生物的真核生物中会分布广泛且值得注意。R-loop 在很多关键性的药理学过程中会发挥关键性新功能，包括肝细胞结构上、磷酸化催化反应、DNA 损伤复建以及真核生物平稳度等，但其如何被精确催化反应的前提已为不确实。m6A 结构上作为信使 RNA 上金属量高达的结构上子类，广泛进行哺乳动物的生长发育、病原体、干蛋白更新、脂肪并存、以及生成和重新分配等生命过程。然而，现今已为不确实 m6A 是否能作为 R -loop 中会 RNA 成份的本源特征来催化反应 R -loop 素质，进而发挥各种药理学新功能。中会科院北平真核生物数据分析所杨运桂、任捷与清华大学生科院孙前文一个团队合作数据分析，挖掘出 m6A 能平稳 R-loop 的过渡到，进而催化反应基因磷酸化的有效取消。这一实质性以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》为题于 10 月 12 日因特网发表于《蛋白数据分析》（Cell Research）杂志。数据分析一个团队首先通过斑点大分子混种和病原体荧光技术，挖掘出敲低 m6A 的大基重新分配酶 METTL3 夙着降低 R -loop 素质，且该催化反应作用依赖于 METTL3 的大基重新分配酶活性。随后，一个团队核心人物透过高效液相色谱法倡议质谱技术，挖掘出相较于DNA结合的 RNA（caRNA），R-loop 的 RNA 成份有更富集的 m6A 结构上。实质性透过基于单肽键 DNA 建库的 DNA：RNA 杂合肽键病原体总计沉淀测序测序技术（ssDRIP-seq），挖掘出下调的 R -loop 主要富集在磷酸化取消区域，R-loop 变化总体与 m6A 的西南方和结构上素质相关。为了探求 m6A 对 R -loop 催化反应的药理学新功能，数据分析一个团队绘制了 RNA 催化反应磷酸化肽肽键的高精度图集，并在 MYC、ACTIN 基因上进行多种磷酸化活性检验，挖掘出 m6A 作出贡献 R -loop 过渡到是磷酸化取消阶段的关键性步骤，可以防止 RNA 催化反应的磷酸化通读。最后，一个团队核心人物紧密结合了针对磷酸化通读的报告基因系统，通过 m6A 结构上肽肽键的突变实质性证实 m6A 对于 R -loop 过渡到及磷酸化取消的关键性作用。该数据分析挖掘出了 m6A 的大基化结构上的总计磷酸化催化反应新功能，揭示了 RNA 的大基化结构上对肝细胞本体的影响，以及 R-loop 本体中会的 RNA 成份被结构上后对其自身稳态的催化反应前提，阐释了 m6A 通过平稳 R-loop 而作出贡献磷酸化正常人取消的现象，为实质性数据分析 m6A 与 R-loop 的催化反应前提和相应药理学新功能提供了大体上的技术和理论支撑。该数据分析获得了中会国科学院关键性先导生物科技专项、国家自然科学以及国家重点生产计划等基金资助。原始出处：Xin Yang， Qian-Lan Liu， Wei Xu， et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).